基于重组抗体片段的蛋白质芯片技术

Protein Microarrays Based on Recombinant Antibody Fragments

 

      Cornelia Steinhauer

      

社:LAMBERT Academic Publishing

号:Q51/S822/2010/Y

藏书地点:武大外教中心

 

微阵列芯片(Microarray)研究始于20世纪80年代末,是在生物遗传学领域发展起来的高密度阵列。起初对微阵列的分类分为cDNA微阵列和寡聚核苷酸微阵列。微阵列上""有大量已知部分序列的DNA探针,利用分子杂交原理,使同时被比较的标本(用同位素或荧光素标记)与微阵列进行杂交,然后通过检测杂交信号的强度,并转化成不同标本中特异基因的丰度而进行数据处理,从而全面比较不同标本的基因表达水平的差异。微阵列技术是一种探索基因组功能的有力手段,其发展契机主要来自于现代遗传学的一些重要发现,并直接收益于该领域的某些重要研究成果,即在载体上固定寡核苷酸的基础上以杂交法测序的技术。因此在发展早期,微阵列芯片有时被通俗的称为生物芯片Biochip,目前媒体和科普读物中仍然常用该名称。微阵列芯片经过近十年的主要发展期,国内外学术界渐渐采用名称Microarray(微阵列芯片),而Biochip(生物芯片)由于这名称容易混淆微阵列芯片和微流控芯片,渐渐该领域用的越来越少了。

芯片技术除了用来检测基因的差异表达,也被用来在蛋白质水平上检测蛋白的表达差异。蛋白质芯片是一种高通量的蛋白功能分析技术,可用于蛋白质表达谱分析,也可以用来研究蛋白质与蛋白质的相互作用,甚至DNA-蛋白质、RNA-蛋白质的相互作用,筛选药物作用的蛋白靶点等。蛋白芯片技术的研究对象是蛋白质,其原理是对固相载体进行特殊的化学处理,再将已知的蛋白分子产物固定其上(如酶、抗原、抗体、受体、配体、细胞因子等),根据这些生物分子的特性,捕获能与之特异性结合的待测蛋白(存在于血清、血浆、淋巴、间质液、尿液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等),经洗涤、纯化,再进行确认和生化分析;它为获得重要生命信息(如未知蛋白组分、序列、体内表达水平生物学功能、与其他分子的相互调控关系、药物筛选、药物靶位的选择等)提供了有力的技术支持。

本书共有六个章节对芯片技术在蛋白质研究中的作用进行介绍。第一章首先对基因组的差异显示背景和技术方法进行了介绍。第二章着重介绍了微阵列芯片技术,除了详细介绍目前应用最为广泛的DNA芯片技术和传统的蛋白质组学技术,还阐述了新兴的蛋白质芯片技术和抗体芯片检测技术。第三章从芯片上的斑点、微阵列处理、芯片的分析原则、数据分析方法等方面介绍了蛋白质微阵列芯片技术。第四章在介绍重组抗体片段制作的探针的同时,也介绍了天然的抗体特点、重组单链抗体的可变区域的选择,以及探针的选择原则等内容。 第五章介绍了蛋白芯片研究中的所用的固体支持物,包括以吸收、共价偶联、亲和偶联为基础的基质。第六章则对蛋白质芯片研究进行了汇总,并且对蛋白芯片研究的前景进行了展望和分析。

本书是技术性和专业性比较强的书籍,系统介绍了如何通过筛选蛋白的可变区域,进而合成特异性比较强的抗体,以及如何进行精细的蛋白质芯片研究,以及如何分析蛋白的表达差异。本书特别适合分子生物学、细胞生物学、生物化学等领域的研究人员阅读。

 

本书目录:

第一章:简介

第二章:微阵列分析

  第一节:DNA芯片

  第二节:传统的蛋白质组学

  第三节:蛋白质芯片

  第四节:抗体芯片

第三章:蛋白质微阵列芯片技术

  第一节:芯片上的斑点

  第二节:微阵列处理

  第三节:分析原则

  第四节:数据分析

第四章:重组抗体片段制作的探针

  第一节:天然的抗体

  第二节:重组单链抗体的可变区域

  第三节:探针的选择  

第五章:固体支持

  第一节:以吸收为基础的基质

  第二节:共价偶联为基础的基质

  第三节:以亲和偶联为基础的基质

第六章:结束语和前景展望

 

    (王书珍)